C - Chemistry – Metallurgy – 12 – N
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
N
C12N 15/11 (2006.01) A61K 38/03 (2006.01) A61K 47/48 (2006.01) C07K 4/00 (2006.01) C07K 7/06 (2006.01) C07K 7/08 (2006.01) C07K 14/00 (2006.01) C07K 14/435 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) C12Q 1/70 (2006.01) G01N 33/50 (2006.01) G01N 33/53 (2006.01) G01N 33/573 (2006.01) G01N 33/68 (2006.01) A61K 38/00 (2006.01)
Patent
CA 2195629
Peptides having general and specific binding affinities for the Src homology region 3 (SH3) domains of proteins are disclosed in the present invention. In particular, SH3 binding peptides have been isolated from three phage-displayed random peptide libraries which had been screened for isolates that bind to bacterial fusion proteins comprising SH3 and glutathione S-transferase (GST). Preferred peptides are disclosed which comprise a core 7-mer sequence (preferably, a consensus motif) and two or more, preferably at least six, additional amino acid residues flanking the core sequence, for a total length of 9, preferably at least 13, amino acid residues and no more than about 45 amino acid residues. Such peptides manifest preferential binding affinities for certain SH3 domains. The preferred peptides exhibit specific binding affinities for the Src-family of proteins. In vitro and in vivo results are presented which demonstrate the biochemical activity of such peptides.
L'invention porte sur des peptides présentant des affinités de fixation générales et spécifiques pour les domaines SH3 (région 3 d'homologie des protéines Src). En particulier des peptides se fixant aux SH3 ont été isolés à partir de trois banques de peptides aléatoires de phages qui ont été triées pour y détecter des isolats se fixant à des protéines obtenues par fusion bactérienne comprenant les SH3 et la glutathione S-transférase (GST). Les peptides préférés présentés comprennent une séquence coeur à 7-mer (de préférence à motif consensus) et deux ou plus, et de préférence au moins 6, résidus additionnels d'acides aminés qui flanquent la séquence coeur, ce qui donne une longueur totale de 9, et de préférence d'au moins 13 et d'au plus 45, résidus d'acides aminés. Ces peptides manifestent des affinités de fixation préférentielles pour certains domaines SH3, et les peptides préférés présentent des affinités de fixation spécifiques pour les protéines de la famille Src. Des résultats obtenus in vitro et in vivo présentés ici démontrent l'activité biochimique de ces peptides.
Der Channing J.
Kay Brian K.
Quilliam Lawrence A.
Sparks Andrew B.
Thorn Judith M.
Osler Hoskin & Harcourt Llp
University Of North Carolina At Chapel Hill
LandOfFree
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