C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01)
Patent
CA 2395920
Generation of longer cDNA fragments from SAGE tags for gene identification (GLGI) is disclosed. This method converts SAGE tags, which are about 10 base pairs in length, into their corresponding 3'cDNA fragments covering hundred bases. This added information provides for more accurate genome-wide analysis and overcomes the inherent deficiencies of SAGE. The generation of longer cDNA fragments from isolated and purified protein fragments for gene identification is also disclosed. This method converts a short amino acid sequence into extended version of the DNA sequences encoding the protein/protein fragment and additional 3' end sequences of the gene encoding the protein. This additional sequence information allows gene identification from purified protein sequences. The invention also provides a high-throughput GLGI procedure for identifying genes corresponding to a set of unidentified SAGE tags.
L'invention concerne la génération de fragments d'ADNc plus longs à partir d'étiquettes de SAGE afin d'identifier des gènes (GLGI). Ce procédé consiste à convertir ces étiquettes de SAGE, dont la longueur possède environ 10 paires de base, en leurs fragments d'ADNc 3' correspondant couvrant 100 bases. Cette information supplémentaire permet d'exécuter une analyse plus précise sur l'étendue du génome et de combler les déficiences inhérentes à SAGE. Elle concerne également la génération de fragments d'ADNc plus longs à partir de fragments de protéines isolées et purifiées afin d'identifier des gènes. Ce procédé consiste à convertir une séquence courte d'acides aminés en versions prolongées des séquences d'ADN codant le fragment protéine/protéine et en séquences supplémentaires de terminaisons 3' du gène codant la protéine. Cette information supplémentaire de séquence permet d'identifier des gènes à partir des séquences de protéine purifiée. L'invention concerne également un procédé extrêmement productif basé sur GLGI et servant à identifier des gènes correspondants à un ensemble d'étiquettes de SAGE non identifiées.
Chen Jianjun
Rowley Janet D.
Wang San Ming
Arch Development Corporation
Goudreau Gage Dubuc
LandOfFree
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