G - Physics – 01 – N
Patent
G - Physics
01
N
G01N 33/68 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) G01N 31/00 (2006.01) G01N 33/53 (2006.01) G06F 17/00 (2006.01) G06F 19/00 (2006.01)
Patent
CA 2415787
A preferred embodiment of the invention is a method for determining a preferred sequence alignment between a query sequence and one or more template sequences comprising the steps of: 1) aligning at least two reference sequences to determine one or more BRIDGE/BULGE gaps; 2) determining an alignment score between each potential alignment of the query sequence and each template sequence based on whether or not a given sequence alignment between the query sequence and each template sequence creates a BRIDGE/BULGE gap and 3) determining a preferred sequence alignment based on the alignment scores of the query sequence with each template sequence.
Un mode de réalisation préféré de cette invention concerne un procédé permettant de déterminer un alignement de séquence préféré entre une séquence de travail et une ou plusieurs séquences modèles, comprenant les étapes consistant: 1) à aligner au moins deux séquences de référence afin de déterminer un ou plusieurs espaces PONT/BOSSE (BRIDGE/BULGE); 2) à déterminer un résultat d'alignement entre chaque alignement potentiel de la séquence de travail et chaque séquence modèle sur la base du fait que oui ou non un alignement de séquence entre la séquence de travail et chaque séquence modèle crée un espace PONT/BOSSE (BRIDGE/BULGE) et 3) à déterminer un alignement de séquence préféré sur la base des résultats d'alignement de la séquence de travail avec chaque séquence modèle.
California Institute Of Technology
Smart & Biggar
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1882597