C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01) C07H 21/04 (2006.01)
Patent
CA 2190471
A sample containing nucleotide sequences is characterized or "fingerprinted" by contacting it, or portions thereof, with a plurality of primer pairs; detecting nucleotide regions delineated by subsequences hybridized with each primer pair, determining a physical characteristic of each such detected region; and indexing such physical characteristics as a function of the primer pair that hybridized to the delineating subsequences of the corresponding region. An apparatus for fingerprinting a sample containing nucleotide sequences includes functionality for carrying out such a process. A kit of primers for use in characterizing, or fingerprinting, a sample comprising one or more nucluotide sequences is produced by a process identifying a first set of primers that hybridize with relative high frequency to respective antisense subsequences putatively present in the sample (or complementary subsequences thereof); identifying a second set of primers that hybridize with relative low frequency to respective sense subsequences putatively present in the sample (or complementary subsequences thereof); and, providing as the kit of primers at least selected primers common to both the first and second sets.
On caractérise ou identifie un échantillon contenant des séquences de nucléotides en le mettant en contact, dans sa totalité ou en partie, avec un ensemble de paires d'amorces; en détectant les régions de nucléotides délimitées par des sous-séquences hybridées avec chaque paire d'amorces; en déterminant une caractéristique physique de chacune des régions ainsi détectées; et en indexant ces caractéristiques physiques comme une fonction de la paire d'amorces hybridée avec les sous-séquences de délimitation de la région correspondante. Un appareil d'identification d'un échantillon contenant des séquences de nucléotides comprend des fonctions permettant de mettre en oeuvre ce processus. On produit un kit d'amorces destiné à être utilisé pour caractériser ou identifier un échantillon comprenant une ou plusieurs séquences de nucléotides, par un processus consistant à identifier un premier ensemble d'amorces qui s'hybrident avec une fréquence relativement élevée avec des sous-séquences antisens respectives éventuellement présentes dans l'échantillon (ou avec des sous-séquences complémentaires); à identifier un deuxième ensemble d'amorces qui s'hybrident avec une fréquence relativement faible avec des sous-séquences sens respectives éventuellement présentes dans l'échantillon (ou avec des sous-séquences complémentaires); et à inclure dans le kit d'amorces au moins des amorces sélectionnées communes aux deux ensembles.
Lopez-Nieto Carlos Eduardo
Nigam Sanjay Kumar
Brigham & Women's Hospital
Riches Mckenzie & Herbert Llp
The Brigham And Women's Hospital
LandOfFree
Processes, apparatus and compositions for characterizing... does not yet have a rating. At this time, there are no reviews or comments for this patent.
If you have personal experience with Processes, apparatus and compositions for characterizing..., we encourage you to share that experience with our LandOfFree.com community. Your opinion is very important and Processes, apparatus and compositions for characterizing... will most certainly appreciate the feedback.
Profile ID: LFCA-PAI-O-1913391