Nucleic acid arrays

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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C12Q 1/68 (2006.01) C07H 21/02 (2006.01) C07H 21/04 (2006.01) C12P 19/34 (2006.01)

Patent

CA 2290738

Arrays of polynucleotide spots and kits comprising the same, as well as methods for their preparation and use are provided. The subject arrays include a plurality of polynucleotide spots stably associated with the surface of a solid support. At least a portion of the polynucleotide spots comprises a polynucleotide probe composition that is made up of unique polynucleotides, where all of the unique polynucleotides of the array correspond to a common type of gene. Also provided are sets of a representational number of gene specific primers suitable for use in generating target nucleic acid for use with the subject arrays. The subject arrays find use in hybridization assays, particularly in assays for the identification of differential gene expression patterns among two or more different types of cells.

On décrit des ensembles de taches de polynucléotides et des kits comprenant ces ensembles, ainsi que des procédés de préparation et d'utilisation de ces derniers. Les ensembles de cette invention comprennent plusieurs taches de polynucléotides qui sont associées de manière stable à la surface d'un support solide. Au moins une partie des taches de polynucléotides comprend une composition de sonde polynucléotidique qui est constituée de polynucléotides uniques, dans laquelle tous les polynucléotides uniques de l'ensemble correspondent à un type commun de gène. On décrit également des groupes d'un nombre représentatif d'amorces spécifiques à un gène appropriées pour être utilisées dans la production d'acide nucléique cible destiné à être utilisé avec les ensembles de cette invention. Ces ensembles sont utiles dans des dosages d'hybridation, plus particulièrement dans des dosages permettant d'identifier des modèles d'expression de gènes différentiels parmi deux ou plusieurs types différents de cellules.

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