Novel process for the synthesis of exochelins

C - Chemistry – Metallurgy – 07 – K

Patent

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C07K 11/00 (2006.01)

Patent

CA 2338781

A process for the synthesis of an Exochelin comprising the steps of generating L-N-[(2-benzyloxy-(benzoyl)]serine or L-N-[2-benzyloxy(benzoyl)] threonine, creating L-N-t-Boc-.epsilon.hydroxynorleucine and reacting same to produce L-N- Boc-.epsilon.-bromonorleucine trimethylsilylethyl ester, providing a dicarboxylic acid and forming an O-benzyl methyl hydroxamate from the dicarboxylic acid, coupling the O-benzyl methyl hydroxamate with the L-N-Boc- .epsilon.-bromonorleucine trimethylsilylethyl ester to give an L-N2-Boc-N6- methyl,N6-(benzyloxy) lysine 2-trimethylsilylethyl ester which incorporates the dicarboxylic acid as modified above, removing the N-tert-butoxycarbonyl protecting group from the L-N2-Boc-N6-methyl,N6-(benzyloxy) lysine 2- trimethylsilylethyl ester to yield a substituted lysine, and coupling the same with the L-N-[2-benzyloxy(benzoyl) serine or -threonine to yield a 2-trimethyl silylethyl ester of dibenzyl Exochelic acid, transforming the 2-trimethyl silylethyl ester of dibenzyl Exochelic acid to dibenzyl Exochelic acid , preparing benzyl epi-cobactin, forming an ester bond between the dibenzyl Exochelic acid and benzyl epi-cobactin to form an intermediate, and, hydrogenolytically removing three benzyl groups from said intermediate, resulting in the synthesized Exochelin. More particularly, a synthesis for Exochelin 786SM (R) is disclosed wherein the dicarboxylic acid is suberic acid and the serine form is utilized.

Ce procédé de synthèse d'une exochéline comprend les étapes consistant à produire une L-N-[2-benzyloxy-(benzoyl)] sérine ou une L-N[2-benzyloxy(benzoyl)]thréonine, à créer une L-N-t-Boc-.epsilon.-hydroxynorleucine et à faire réagir celle-ci afin d'obtenir un triméthylsilyléthylester de L-N-Boc-.epsilon.-bromonorleucine, à préparer un acide dicarboxylique et à former un hydroxamate de O-benzylméthyle, à partir de l'acide dicarboxylique, à coupler cet hydroxamate avec le triméthylsilyléthyle de L-N-Boc-.epsilon.-bromonorleucine, afin d'obtenir un 2-triméthylsilyléthylester de L-N?2¿-Boc-N?6¿-méthyl,N?6¿-(benzyloxy)lysine, lequel comprend l'acide dicarboxylique tel que modifié ci-dessus, puis à enlever le groupe protecteur N-tert-butoxycarbonyle du 2-triméthylsilyléthyléthyle de L-N?2¿-Boc-N?6¿-méthyl,N?6¿-(benzyloxy)lysine, afin de produire une lysine substituée, et à coupler celle-ci avec la L-N-[2-benzyloxy(benzoyl)]sérine ou -thréonine, afin d'obtenir un 2-triméthylsilyléthylester d'acide exochélique dibenzylique que l'on transforme en acide éxochélique dibenzylique, à préparer une épi-cobactine de benzyle, à former une liaison ester entre l'acide exochélique dibenzylique et l'épi-cobactine de benzyle afin de former un intermédiaire, duquel on enlève de manière hydrogénolytique les trois groupes benzyle, afin d'obtenir une exochéline synthétisée. L'invention concerne notamment une synthèse de l'exochéline 786SM(R) dans laquelle l'acide dicarboxylique est de l'acide subérique et dans laquelle on utilise la forme sérine.

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