Charge-modified nucleic acid terminators

Details Charge-modified nucleic acid terminators Charge-modified nucleic acid terminators

C - Chemistry, Metallurgy

07

H

C07H 19/10 (2006.01) A61K 31/7052 (2006.01) A61P 31/12 (2006.01) C07H 19/20 (2006.01) C12N 9/12 (2006.01) C12P 19/34 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) G01N 33/53 (2006.01)

Patent

CA 2382063

Charge-modified nucleic acid terminators comprising structure (I): Z-X-S-B-L wherein Z is mono-, di- or triphosphate or thiophosphate, or corresponding boranophosphate; X is O, CH2, S, or NH; S is a sugar or a sugar analogue; B is a naturally occuring or a synthetic base; L is alkyl, alkenyl, or alkynyl and is optionally substituted with a reporter moiety; and L, B, S, X, or Z are substituted with a moiety which imparts a net negative charge or a net positive charge to structure (I) at physiological or nucleic acid sequencing conditions. A method of sequencing nucleic acids using the above charge- modified terminators, as well as a method of inhibiting a virus which comprises contacting a cell infected with a virus with a virus-inhibiting amount of the above charge-modified terminator are also disclosed.

L'invention concerne des terminateurs d'acide nucléique à charge modifiée présentant la structure (I), dans laquelle Z est mono-, di- ou triphosphate ou thiophosphate, ou boranophosphate correspondant, X est O, CH¿2?, S ou NH, S est un sucre ou un analogue de sucre, B est une base naturelle ou synthétique, L est alkyle, alcényle ou alkynyle éventuellement substitué par un groupe fonctionnel rapporteur, et L, B, S, X ou Z sont substitués par un groupe fonctionnel qui confère une charge négative nette ou une charge positive nette à la structure (I) dans des conditions physiologiques ou lors d'un séquençage d'acides nucléiques. L'invention concerne également une méthode de séquençage d'acides nucléiques faisant intervenir les terminateurs à charge modifiée susmentionnés, ainsi qu'une méthode d'inhibition d'un virus consistant à faire venir une cellule infectée par un virus au contact d'une dose inhibitrice de virus du terminateur à charge modifiée susmentionné.

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