Methods and kits for amplifying dna

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – P

Patent

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Details

C12P 19/34 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) C07H 21/00 (2006.01)

Patent

CA 2678799

Novel methods of synthesizing multiple copies of a target nucleic acid sequence which are autocatalytic are disclosed (/. e., able to cycle automatically without the need to modify reaction conditions such as temperature, pH, or ionic strength and using the product of one cycle in the next one). In particular, methods of nucleic acid amplification are disclosed which are robust and efficient, while reducing the appearance of side-products. In general, the methods use priming oligonucleotides that target only one sense of a target nucleic acid, a promoter oligonucleotide modified to prevent polymerase extension from its 3 '-terminus and, optionally, a means for terminating a primer extension reaction, to amplify RNA or DNA molecules in vitro, while reducing or substantially eliminating the formation of side-products. The disclosed methods minimizes or substantially eliminate the emergence of side-products, thus providing ahigh level of specificity. Furthermore, the appearance of side-products can complicate the analysis of the amplification reaction by various molecular detection techniques. The disclosed methods minimize or substantially eliminate this problem, thus providing enhanced levels of sensitivity.

L'invention concerne de nouveaux procédés de synthèse de plusieurs copies d'une séquence cible d'acide nucléique, qui sont autocatalytiques (à savoir, capables d'effectuer des cycles automatiquement sans nécessité de modifier les conditions de réaction telles que la température, le pH ou la force ionique et en utilisant le produit d'un cycle dans le suivant). En particulier, l'invention concerne des procédés d'amplification d'acide nucléique, qui sont robustes et efficaces, tout en réduisant l'apparition de produits secondaires. De manière générale, les procédés utilisent des oligonucléotides amorces, qui ciblent seulement un sens de l'acide nucléique cible, un oligonucléotide promoteur modifié pour prévenir l'extension par polymérase depuis son extrémité 3' et le cas échéant, un moyen pour terminer une réaction d'extension d'amorce, pour amplifier des molécules d'ARN ou d'ADN in vitro, tout en réduisant ou en éliminant sensiblement la formation de produits secondaires. Les procédés décrits minimisent ou éliminent sensiblement l'émergence de produits secondaires, produisant ainsi un niveau élevé de spécificité. De plus, l'apparition de produits secondaires peut compliquer l'analyse de la réaction d'amplification par différentes techniques de détection moléculaire. Les procédés décrits minimisent ou éliminent sensiblement ce problème, procurant ainsi des niveaux amplifiés de sensibilité.

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