C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01) C07K 16/32 (2006.01)
Patent
CA 2732658
The invention provides methods for treating patients which methods comprise methods for predicting responses of cells, such as tumor cells, to treatment with therapeutic agents. These methods involve measuring, in a sample of the cells, levels of one or more components of a cellular network and then computing a Network Activation State (NAS) or a Network Inhibition State (NIS) for the cells using a computational model of the cellular network. The response of the cells to treatment is then predicted based on the NAS or NIS value that has been computed. The invention also comprises predictive methods for cellular responsiveness in which computation of a NAS or NIS value for the cells (e.g., tumor cells) is combined with use of a statistical classification algorithm. Biomarkers for predicting responsiveness to treatment with a therapeutic agent that targets a component within the ErbB signaling pathway are also provided.
L'invention concerne des procédés pour traiter des patients, les procédés comprenant des procédés pour prévoir des réponses de cellules, comme des cellules tumorales, à un traitement à l'aide d'agents thérapeutiques. Ces procédés impliquent la mesure, dans un échantillon des cellules, de niveaux d'un ou de plusieurs composants d'un réseau cellulaire, et ensuite le calcul d'un état d'activation de réseau (NAS) ou d'un état d'inhibition de réseau (NIS) pour les cellules, en utilisant un modèle de calcul du réseau cellulaire. La réponse des cellules à un traitement est ensuite prévue sur la base de la valeur NAS ou NIS qui a été calculée. L'invention concerne également des procédés prédictifs pour une sensibilité cellulaire, ou un calcul d'une valeur NAS ou NIS pour les cellules (par exemple des cellules tumorales) est combiné avec l'utilisation d'un algorithme de classification statistique. Des biomarqueurs pour prévoir une sensibilité à un traitement à l'aide d'un agent thérapeutique qui cible un composant dans le trajet de signalisation d'ErbB sont également fournis.
Fitzgerald Jonathan Basil
Gibbons Francis David
Harms Brian
Kubasek William
Nielsen Ulrik
Merrimack Pharmaceuticals Inc.
Osler Hoskin & Harcourt Llp
LandOfFree
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