C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01) C40B 30/00 (2006.01) C40B 30/02 (2006.01) C40B 40/06 (2006.01) G01N 33/68 (2006.01) G06F 19/00 (2011.01)
Patent
CA 2758041
A process to identify tumour characteristics involves obtaining three different marker sets each predictive of a characteristic of interest, obtaining a sample gene expression signals from tumour cells, adding a reporter to affect a change in the sample permitting assessment of a gene expression signal of interest in the tumour, combining the gene expression signals with the reporter, correlating the extracted gene expression signals to the three different marker sets, assigning a designation to the extracted gene expression signals according to the following rankings: if the correlation of all three predictive gene expression signal sets predict it to have characteristics of concern, it is designated a bad tumour; if the correlation of all three predictive gene expression signal sets predict it to lack characteristics of concern it is designated a good tumour; and, if the correlation of all three predictive gene expression signal sets do not provide the same predicted clinical outcome, the tumour is designated as "intermediate"; and, outputting said designation.
L'invention porte sur un procédé pour identifier des caractéristiques tumorales, lequel procédé met en jeu l'obtention de trois différents ensembles de marqueurs chacun prédisant une caractéristique d'intérêt, l'obtention de signaux d'expression génique d'échantillon à partir de cellules tumorales, l'addition d'un reporteur pour affecter un changement dans l'échantillon permettant une évaluation d'un signal d'expression génique d'intérêt dans la tumeur, la combinaison des signaux d'expression génique avec le reporteur, la corrélation des signaux d'expression génique extraits avec les trois différents ensembles de marqueurs, l'attribution d'une désignation aux signaux d'expression génique extraits conformément aux classements suivants : si la corrélation de la totalité des trois ensembles de signaux d'expression génique prédictifs la prédisent comme ayant des caractéristiques d'intérêt, elle est désignée comme étant une mauvaise tumeur ; si la corrélation de la totalité des trois ensembles de signaux d'expression génique prédictifs la prédisent comme manquant de caractéristiques d'intérêt, elle est désignée comme étant une bonne tumeur ; et si la corrélation de la totalité des trois ensembles de signaux d'expression génique prédictifs ne conduit pas au même résultat clinique prédit, la tumeur est désignée comme étant « intermédiaire » ; et la délivrance en sortie de ladite désignation.
Deng Yinghai
Lenferlnk Anne E. G.
Li Jie
O'connor-Mccourt Maureen D.
Purisima Enrico
Koenig Hans
National Research Council Of Canada
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-2024363