G - Physics – 06 – F
Patent
G - Physics
06
F
G06F 17/50 (2006.01) G06F 17/30 (2006.01) G06F 19/00 (2006.01)
Patent
CA 2363020
A method and system for dynamic storage, retrieval and display of experimental information with determined relationships. A graphical user interface is presented from which shapes and arrows representing biological entities and transformations respectively, can be input and edited. Multidimensional information based on a pre-determined hierarchy is input to link the entities and transformations to additional information about the entities and transformations. Related information, if any, is input to link the entities and transformations to other information in plural external databases on a public network such as the Internet. Information associated with plural shapes connected with plural arrows is saved as a biological pathway with determined relationships in a database. The biological pathway defines a hierarchical representation of a biological function with determined relationships between entities and transformations. Biological pathway diagrams such as cell pathways with determined relationships may be dynamically input, edited and dynamically generated to represent biological functions, such as cellular functions, to enable a user to visually interact with identified dimensions of biological information. A user may dynamically navigate through identified dimensions of biological information to find out a relationship of a specific piece of biological information with other pieces of biological information. The method and system may help facilitate the abstraction of knowledge from information for biological pathways and provide new bioinformatic techniques.
L'invention concerne un procédé et un système de stockage, de recherche et d'affichage dynamiques de données expérimentales à relations déterminées. Une interface utilisateur graphique est présentée, à partir de laquelle des formes et des flèches représentant respectivement des entités biologiques et des transformations, peuvent être introduites ou modifiées. Des données multidimensionnelles basées sur une hiérarchie prédéterminée sont introduites afin de relier les entités et les transformations aux données additionnelles relatives aux entités et aux transformations. Les données relatives, s'il en existe, sont introduites afin de relier les entités et les transformations à d'autres données de plusieurs bases de données extérieures sur un réseau public, tel qu'Internet. Les données associées à diverses formes reliées avec plusieurs flèches sont sauvegardées dans une base de données en tant que voie biologique comportant des relations déterminées. La voie biologique définit une représentation hiérarchique d'une fonction biologique comportant des relations déterminées entre les entités et les transformations. Les diagrammes de la voie biologique, tels que des voies cellulaires comportant des relations déterminées peuvent être introduits, modifiés et générés de manière dynamique pour représenter des fonctions biologiques, telles que des fonctions cellulaires, de façon à permettre à un utilisateur d'agir visuellement sur des dimensions identifiées des données biologiques. Un utilisateur peut explorer de manière dynamique des dimensions identifiées des données biologiques pour découvrir une relation de données biologiques spécifiques avec d'autres données biologiques. Le procédé et le système peuvent contribuer à faciliter l'abstraction de connaissances à partir de données relatives aux voies biologiques, et fournir de nouvelles techniques bioinformatiques.
Harrington Christopher C.
Qu Long
Taylor D. Lansing
Wang Jian
Cellomics Inc.
Mbm & Co.
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1982131